【1】參與主體不一樣：銀行間市場的參與主體是金融機構，包括商業銀行、農村信用聯社、保險公司、證券公司等金融機構;交易所市場則面向所有的投資者。

【2】交易方式不一樣：銀行間市場采取詢價交易的交易方式，交易對手由自己選定;交易所市場則是采取競價交易的交易方式，交易對手是由交易所撮合產生。

銀行間市場和交易所市場的主要區別，債券交易的市場除了這兩大市場之外，還有銀行柜臺交易市場，即銀行通過營業網點(含電子銀行系統)與投資人進行債券買賣，并辦理相關托管與結算等業務的行為。對于個人投資者而言，則主要通過交易所市場與銀行柜臺交易市場來投資買賣債券。