目前，個稅專項附加扣除申報方式有扣繳義務(wù)人申報和綜合所得年度自行申報兩種。

扣繳義務(wù)人申報

扣繳義務(wù)人申報是按月來進行個稅專項附加扣除的，由單位財務(wù)人員進行操作，納稅人在取得收入的當月就可以享受稅收優(yōu)惠，比較適合收入來源比較單一的納稅人。

綜合所得年度自行申報

綜合所得年度自行申報是先將個人所得稅進行扣除，然后在來年由納稅人自行前往當?shù)囟悇?wù)部門辦理個稅專項附加扣除申報，然后由稅務(wù)部門辦理退稅。一般來說，綜合所得年度自行申報比較適合收入來源比較廣泛的人。