一是監(jiān)管理念不同，從貨物管理轉(zhuǎn)變?yōu)槠髽I(yè)管理；二是貿(mào)易的開放度不同，實行與國際接軌的多元貿(mào)易模式；三是政策的開放度不同，主要體現(xiàn)在投資管理和外匯政策。

保稅區(qū)是貨物一旦進入到這個區(qū)域，就要受到海關(guān)的監(jiān)管。而自貿(mào)區(qū)的正常貿(mào)易，海關(guān)是不會干涉的，貨物的自由買賣、儲存等都不受海關(guān)的監(jiān)管。