注冊制對證券賬戶沒有風險，不過注冊制會加大股票交易的風險，注冊制會加大股票波動幅度，比如非注冊制下，股票漲跌幅限制為10%，實行注冊制后，股票漲跌幅限制為20%，并且冊制降低了企業上市的門檻，也就增加了踩雷的風險，再加上注冊制是一個去散戶化的過程，散戶投資更加困難，注冊制后股票價值由市場決定，投資者自己進行價值的判斷，投資操作難度增加。

注冊制是公開發行管理原則，在注冊制下證券發行審核機構只對注冊文件進行形式審查，不進行實質判斷，股票注冊制后，散戶依然可以投資，但開通門檻有所提高。