1、代碼不同：上證指數代碼為000001，上證個股代碼以60開頭，深證指數代碼為399001，深證個股代碼以00開頭。

2、上市場所不同：上證在上海交易所交易，深證在深圳交易所交易。

3、新股停牌規則不同：滬市新股上市首日漲幅達到規定的限制，停牌30分鐘，深市新股上市首日盤中漲幅與開盤漲幅之差首次達到10%時，交易所對其實施臨時停牌30分鐘。